RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 HLA-DQA2P01906 255 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 IGFBP5P24593 272 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ARF5P84085 180 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 CAPSQ13938 189 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 NOMO1Q15155 1222 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 XKR6Q5GH73 641 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 WSCD1Q658N2 575 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 LINGO1Q96FE5 620 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 SEMA3CQ99985 751 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ABCB9Q9NP78 766 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 PCDH8O95206 1070 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF460Q14592 562 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 GPAT3Q53EU6 434 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TEX44Q53QW1 395 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 BICRALQ6AI39 1079 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 LIN54Q6MZP7 749 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 MTSS1LQ765P7 747 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 SUN5Q8TC36 379 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TNFRSF25Q93038 417 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TAMM41Q96BW9 452 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TIMM22Q9Y584 194 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TPTEP56180 551 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TUBA1BP68363 451 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TUBA1AQ71U36 451 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 GPR156Q8NFN8 814 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 IDI2Q9BXS1 227 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 CACNA1SQ13698 1873 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 FAM92AA1XBS5 289 aa6.33□□□□□ -1.4
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SBNO1-201ENST00000267176 GPR158Q5T848 1215 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ANO7Q6IWH7 933 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 GAD1Q99259 594 aa6.33□□□□□ -1.4
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SBNO1-201ENST00000267176 GMFBP60983 142 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 REP15Q6BDI9 236 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 AHSA2Q719I0 299 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 SENP8Q96LD8 212 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 COPS4Q9BT78 406 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 DHFRP00374 187 aa6.33□□□□□ -1.4
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SBNO1-201ENST00000267176 HM13Q8TCT9 377 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 NELL1Q92832 810 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 LHX5Q9H2C1 402 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.33□□□□□ -1.4
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SBNO1-201ENST00000267176 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 SLC28A1O00337 649 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 C9P02748 559 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 PTGIRP43119 386 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TGM3Q08188 693 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 UNC93AQ86WB7 457 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 PLD5Q8N7P1 536 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 CNTD1Q8N815 330 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.33□□□□□ -1.4
SBNO1-201ENST00000267176 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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