RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 ANKHQ9HCJ1 492 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 XPR1Q9UBH6 696 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CFL2Q9Y281 166 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 C9IYK1 514 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TCEA3O75764 348 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 MPOP05164 745 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 RORAP35398 523 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ELP6Q0PNE2 266 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 KDELC2Q7Z4H8 507 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NLRX1Q86UT6 975 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TBC1D15Q8TC07 691 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 MMP19Q99542 508 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SEC14L4Q9UDX3 406 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM59LQ9UK28 342 aa10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 LRRC14BA6NHZ5 514 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CASP3P42574 277 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 MTHFRP42898 656 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PTGER2P43116 358 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CBX5P45973 191 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 GRIA4P48058 902 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 UGT2B15P54855 530 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ERVK-25P63136 954 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CAMK2BQ13554 666 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 COL19A1Q14993 1142 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 STILQ15468 1287 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NPTX1Q15818 432 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 GFOD2Q3B7J2 385 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SBK1Q52WX2 424 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 EFHC2Q5JST6 749 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 DYNLL2Q96FJ2 89 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ERVK-6Q9BXR3 956 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TLE6Q9H808 572 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 C17orf75Q9HAS0 396 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NRBP2Q9NSY0 501 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ERVK-18Q9QC07 812 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 AASSQ9UDR5 926 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 GLS2Q9UI32 602 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ACSL5Q9ULC5 683 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 MAFFQ9ULX9 164 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NCANO14594 1321 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 BTN3A1O00481 513 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CASKO14936 926 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PRMT3O60678 531 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ATP6AP2O75787 350 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SCO1O75880 301 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 DNAJB5O75953 348 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CD2P06729 351 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SDC2P34741 201 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PLK1P53350 603 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 HERVK_113P63132 956 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NOMO3P69849 1222 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CSHL1Q14406 222 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NOMO1Q15155 1222 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SGO1Q5FBB7 561 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 LIN54Q6MZP7 749 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PADI6Q6TGC4 694 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SLC51BQ86UW2 128 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NEURL2Q9BR09 285 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 CNPPD1Q9BV87 410 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 AMNQ9BXJ7 453 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 IL7RP16871 459 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 FEN1P39748 380 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NNMTP40261 264 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 ESX1Q8N693 406 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PTERQ96BW5 349 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PSD2Q9BQI7 771 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 DOCK2Q92608 1830 aa10.63□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.62□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 SLC30A4O14863 429 aa10.62□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 RASGRP1O95267 797 aa10.62□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 PGK1P00558 417 aa10.62□□□□□ -0.71
KPNA3-201ENST00000261667 GPIP06744 558 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms