RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216044.9

GTPBP1-201, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP1, Length 5,126 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-201ENST00000216044 ACADMP11310 421 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 TCF4P15884 667 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 GMFBP60983 142 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 ATP1A4Q13733 1029 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CYP1B1Q16678 543 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 NETO2Q8NC67 525 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 MYDGFQ969H8 173 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 ACOX2Q99424 681 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CIPCQ9C0C6 399 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 USP12O75317 370 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 GALTP07902 379 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CA9Q16790 459 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 NACC2Q96BF6 587 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CPNE1Q99829 537 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 SCN4AP35499 1836 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 E9PAM4 449 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CYP7B1O75881 506 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 LRIG2O94898 1065 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CSHL1Q14406 222 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 FGD3Q5JSP0 725 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 TRPV3Q8NET8 790 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 ITFG1Q8TB96 612 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 KCNN1Q92952 543 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 TCF25Q9BQ70 676 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.59□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 EPN2O95208 641 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 FGF19O95750 216 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 WEE1P30291 646 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 RPTNQ6XPR3 784 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 NTAN1Q96AB6 310 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 C8orf48Q96LL4 319 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.58□□□□□ -0.07
GTPBP1-201ENST00000216044 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TBL1XO60907 577 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 S100A3P33764 101 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 GPR17Q13304 367 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 QPRTQ15274 297 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 STK32CQ86UX6 486 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MPP4Q96JB8 637 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 LYNP07948 512 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SMYD1Q8NB12 490 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 A0A087X1B8 175 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 PTGIRP43119 386 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 NEK3P51956 506 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.58□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CCDC182A6NF36 153 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 INPP4BO15327 924 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 UMPSP11172 480 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 STARP49675 285 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 RGS21Q2M5E4 152 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 SIPA1L1O43166 1804 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 HAT1O14929 419 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 IRAK2O43187 625 aa14.57□□□□□ -0.08
GTPBP1-201ENST00000216044 RHOQP17081 205 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms