RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam83fQ3UKU4 495 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Akap14Q3V0I7 536 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ptpn18Q61152 453 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Shkbp1Q6P7W2 704 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 StgQ8BM15 349 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Camk1dQ8BW96 385 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nle1Q8VEJ4 485 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B3galt6Q91Z92 325 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 KlbQ99N32 1043 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sytl2Q99N50 950 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9D979 236 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spatc1lQ9D9W0 342 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PyglQ9ET01 850 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Grin3aA2AIR5 1135 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11239E9Q5Z9 360 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11237F2Z3W5 360 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11238F2Z478 360 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 F830016B08RikG3UWE2 416 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 2610028H24RikG5E8K1 270 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BC024978J3QPC3 361 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r88L7N1W8 857 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MrasO08989 208 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apoa4P06728 395 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ZfaP23607 742 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mxd1P50538 227 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fut7Q11131 389 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm428Q3UTE2 360 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mocs1Q5RKZ7 636 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mfsd3Q5U419 412 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fnip1Q68FD7 1165 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RadilQ69Z89 1099 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Akap7Q7TN79 314 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf423Q80TS5 1292 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpc7Q9WVC5 862 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5483B2RV77 97 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp4f17G3UW78 524 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ptpn20O55082 426 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sbk3P0C5K0 361 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpc4P51655 557 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Col19a1Q0VF58 1136 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trim35Q8C006 501 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prr33Q8C494 260 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TbcelQ8C5W3 424 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpv3Q8K424 791 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wnt9aQ8R5M2 365 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cybrd1Q925G2 290 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp4f16Q99N17 524 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem80Q9D3H0 123 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930524N10RikQ9D519 233 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clcn5Q9WVD4 746 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ism1A2ATD1 454 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kbtbd6E9PYD7 486 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kbtbd7G5E8C2 690 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc6a13P31649 602 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PgrQ00175 926 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm1604bQ3TRG0 118 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc61Q3UJV1 511 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmed1Q3V009 227 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Actr3bQ641P0 418 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SvoplQ6PDF3 494 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prdx6bQ8BG37 224 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc34Q8C0Q3 554 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gbp5Q8CFB4 590 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mark4Q8CIP4 752 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PvrQ8K094 408 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r205Q8R276 316 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Otud7aQ8R554 926 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc39cQ8VE09 580 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr348Q8VGK3 313 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rad51cQ924H5 366 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lyrm1Q9CQB7 122 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CutalQ9D1U5 156 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atad1Q9D5T0 361 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nrf1Q9WU00 503 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IsxA1A546 240 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1600015I10RikE9Q745 711 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6351K9J7D1 481 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1022L7MTT3 315 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cd151O35566 253 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hes2O54792 157 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fkbp7O54998 218 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phkg1P07934 388 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 St14P56677 855 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lzts1P60853 599 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GaltQ03249 379 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sdr16c6Q05A13 316 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eps8Q08509 821 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnajb14Q149L6 379 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4981Q3ULJ8 291 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Afg1lQ3V384 480 aa20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.8 ms