RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clptm1lQ8BXA5 539 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacnb2Q8CC27 655 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FgbQ8K0E8 481 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan14Q8QZY6 270 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GMCL1P1Q99N64 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htra3Q9D236 459 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc97Q9DBT3 340 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdelc1Q9JHP7 502 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prmt1Q9JIF0 371 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sept6Q9R1T4 434 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apobec2Q9WV35 224 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skint1A7TZE6 364 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp963D3Z2T8 383 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pot1bH7BX60 640 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrymO54983 313 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01631 113 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01648 108 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scd1P13516 355 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tap1P21958 724 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabrr2P56476 465 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts8P57110 905 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmc1Q61880 340 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp719Q8BIV1 735 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptk7Q8BKG3 1062 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MylipQ8BM54 445 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smad3Q8BUN5 425 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psapl1Q8C1C1 522 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asb14Q8C6Y6 587 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ces2aQ8QZR3 558 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Etv3Q8R4Z4 513 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Setd7Q8VHL1 366 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AjubaQ91XC0 547 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtfr1Q99MB2 328 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pramel1Q99MW3 458 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4921530L21RikQ9CQ47 274 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Marc1Q9CW42 340 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata9Q9D9R3 252 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap4s1Q9WVL1 144 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trbv4A0A075B5I2 113 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam43bA2AM80 330 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fpr-rs3O88537 343 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc2a7P0C6A1 513 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eno3P21550 434 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fitm2P59266 262 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfml2bQ3V1G4 746 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fastkd1Q6DI86 829 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf280cQ6P3Y5 742 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Paqr9Q6TCG2 375 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgat5bQ765H6 792 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1037Q7TR84 321 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec18aQ7TSQ1 534 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcng4Q80XM3 506 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapkap1Q8BKH7 522 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LnpepQ8C129 1025 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb10Q8K1K6 397 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec16bQ91XT4 1051 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gmpr2Q99L27 348 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5415E9PXF3 478 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr292F8VQ84 308 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gas2P11862 314 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msr1P30204 458 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr3P35413 330 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smpdl3bP58242 456 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sap25Q1EHW4 186 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trafd1Q3UDK1 580 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcd2Q61285 741 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr17Q6NS65 339 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fastkd5Q7TMV3 762 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rxfp4Q7TQP4 414 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr213Q7TS32 327 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr62Q80UC6 358 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psd4Q8BLR5 1005 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tusc3Q8BTV1 347 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlk1Q8C0V0 766 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsg1Q8R1W2 324 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClyblQ8R4N0 338 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssxb1Q9CPU1 170 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P2yr13Q9D8I2 337 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Copg1Q9QZE5 874 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmd13Q9WVJ2 376 aa12.65□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PikfyveQ9Z1T6 2097 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r70K7N702 854 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3239L7N2D9 227 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MutP16332 748 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap1g1P22892 822 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casp2P29594 452 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PpargP37238 505 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neurog1P70660 244 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sorbs2Q3UTJ2 1180 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kpna1Q60960 538 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.1 ms