RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		A4D1N5	150 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT87P	A6NCN2	255 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		K7EPI3	171 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CTDSP2	O14595	271 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS11D	O60235	418 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TLR2	O60603	784 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PAGE4	O60829	102 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM16	O95361	564 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C22orf31	O95567	290 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	UROD	P06132	367 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RB1	P06400	928 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SRC	P12931	536 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ACP5	P13686	325 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HGF	P14210	728 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CREB1	P16220	341 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ERCC2	P18074	760 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GABRB1	P18505	474 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RBL1	P28749	1068 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CASQ1	P31415	396 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TTK	P33981	857 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PBX3	P40426	434 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPH	P41219	470 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MTHFR	P42898	656 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NT5C2	P49902	561 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KHK	P50053	298 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RCAN1	P53805	252 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PNLIPRP2	P54317	469 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GMFB	P60983	142 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	STX1B	P61266	288 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZXDB	P98169	803 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CFHR3	Q02985	330 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF91	Q05481	1191 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DEUP1	Q05D60	604 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	INA	Q16352	499 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTA3	Q16772	222 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AAK1	Q2M2I8	961 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IRGC	Q6NXR0	463 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR93	Q6P2C0	686 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM65	Q6PI78	240 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RANBP10	Q6VN20	620 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IPMK	Q8NFU5	416 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP76	Q8TAP6	659 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	BICD2	Q8TD16	824 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SGCD	Q92629	289 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SMARCE1	Q969G3	411 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAR2	Q96K12	515 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	EGFL8	Q99944	293 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NYX	Q9GZU5	481 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC18	Q9H819	358 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	POLE3	Q9NRF9	147 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HEY2	Q9UBP5	337 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	URAD	A6NGE7	173 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IFITM10	A6NMD0	228 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957		A8MVJ9	347 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM25E	A8MYX2	175 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM86B1	E9PN63	330 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NKX2-8	O15522	239 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD10	O75832	226 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX4	O95219	450 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FTCD	O95954	541 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		2.87	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSA	P10619	480 aa		2.87	□□□□□ -1.95

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