RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.8□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0J9YYE9 177 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 D6RAR5 112 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 MATN3O15232 486 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 KLK10O43240 276 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 MAP3K6O95382 1288 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBC1P01850 177 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 MMP2P08253 660 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CCNB1P14635 433 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 KELP23276 732 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CCNCP24863 283 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CCKBRP32239 447 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SERPINB6P35237 376 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CXADRP78310 365 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 DSC2Q02487 901 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 GBE1Q04446 702 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CLN3Q13286 438 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 KRT81Q14533 505 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SPRED1Q7Z699 444 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC39A7Q92504 469 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 RAPGEF5Q92565 580 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SCAMP4Q969E2 229 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.79□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 HGFP14210 728 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 KDELR1P24390 212 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 UGT1A5P35504 534 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 NR1D2Q14995 579 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 PDK2Q15119 407 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC18A3Q16572 532 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC66Q68CR7 880 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 DENND2CQ68D51 928 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB11FIP2Q7L804 512 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CCNJLQ8IV13 435 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CNTD1Q8N815 330 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 COX14Q96I36 57 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJC7Q99615 494 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CHP1Q99653 195 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF670Q9BS34 389 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 DTLQ9NZJ0 730 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SUFUQ9UMX1 484 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 CHKBQ9Y259 395 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa11.78□□□□□ -0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 PLD2O14939 933 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 PPM1DO15297 605 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 HLA-DQB2P05538 268 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 IVLP07476 585 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 ITGA2BP08514 1039 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 H2AFZP0C0S5 128 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 MAN1A1P33908 653 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 ADCY8P40145 1251 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 ETV5P41161 510 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 STC1P52823 247 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 INHBCP55103 352 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 TPM4P67936 248 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 CTBSQ01459 385 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 CFHR1Q03591 330 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 H2AFVQ71UI9 128 aa11.77□□□□□ -0.53
CLSTN3-211ENST00000541667 NAGSQ8N159 534 aa11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms