RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530368.1

RRM1-208, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 5

Gene RRM1, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-208	ENST00000530368	OAZ2	O95190	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TUBB	P07437	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	MXI1	P50539	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	NUDT6	P53370	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	NEDD9	Q14511	834 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	KCTD2	Q14681	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	RND1	Q92730	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	ACOX2	Q99424	681 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	SCAMP1	O15126	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	INSIG1	O15503	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	ASAP2	O43150	1006 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	FIBP	O43427	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PGM3	O95394	542 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	NTN1	O95631	604 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CD58	P19256	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	MAOA	P21397	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	RAD52	P43351	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CAMP	P49913	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	NAB2	Q15742	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	SGCD	Q92629	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	WNT9B	O14905	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	JRK	O75564	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TSPAN9	O75954	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TPPP	O94811	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	GPT	P24298	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	ARRB2	P32121	409 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368		Q0VFX4	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	EPS8	Q12929	822 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	GAD1	Q99259	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRM1-208	ENST00000530368	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRM1-208	ENST00000530368	KCNAB3	O43448	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRM1-208	ENST00000530368	HS6ST1	O60243	411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRM1-208	ENST00000530368	NDUFS7	O75251	213 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRM1-208	ENST00000530368	BEST1	O76090	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRM1-208	ENST00000530368	KCNK5	O95279	499 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms