RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 CLRN2A0PK11 232 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 EVPLLA8MZ36 301 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 H0Y626 953 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 DCLK1O15075 740 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 DYRK3O43781 588 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 MAN1A2O60476 641 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 PRSS23O95084 383 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM16O95361 564 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 CLIC3O95833 236 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 PTTG1O95997 202 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 PGK1P00558 417 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21e-8■■■■□ 23.7
HMBOX1-211ENST00000524238 CPB1P15086 417 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 NMBRP28336 390 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 AXLP30530 894 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 AVPR1AP37288 418 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 GRIK1P39086 918 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 GSK3BP49841 420 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC26A2P50443 739 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 TUBA1BP68363 451 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 CHRNB3Q05901 458 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 SELENBP1Q13228 472 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 NFYCQ13952 458 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 PLCL1Q15111 1095 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC14A2Q15849 920 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 FXNQ16595 210 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 TTC23LQ6PF05 361 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 TUBA1AQ71U36 451 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 FUNDC1Q8IVP5 155 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 SETD9Q8NE22 299 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 LILRB4Q8NHJ6 448 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 GIPC2Q8TF65 315 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 RORBQ92753 470 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM63Q969Q1 353 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 NODALQ96S42 347 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 CMTM6Q9NX76 183 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 DPP3Q9NY33 737 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 USE1Q9NZ43 259 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 MAP10Q9P2G4 905 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 C3orf18Q9UK00 162 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 HES2Q9Y543 173 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.52□□□□□ -1.2
HMBOX1-211ENST00000524238 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SYCE1LA8MT33 242 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SNPHO15079 494 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNH1O95259 989 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 SEC24AO95486 1093 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CHEK2O96017 543 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KRT6AP02538 564 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 CHRNA1P02708 482 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KRT6BP04259 564 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ALPLP05186 524 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 KRT8P05787 483 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 HDCP19113 662 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ELK4P28324 431 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 OXTRP30559 389 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 RYKP34925 604 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 ABCG1P45844 678 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 GEMP55040 296 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DEFA1P59665 94 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 DEFA3P59666 94 aa7.52□□□□□ -1.21
HMBOX1-211ENST00000524238 LIPEQ05469 1076 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms