RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 DPTQ07507 201 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 TRAF2Q12933 501 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 NFATC3Q12968 1075 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 STX1AQ16623 288 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 MAP9Q49MG5 647 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 VASH2Q86V25 355 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 NAGSQ8N159 534 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 SCRN2Q96FV2 425 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 NUDT22Q9BRQ3 303 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 ZWILCHQ9H900 591 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 NOD2Q9HC29 1040 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 ETNK2Q9NVF9 386 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 AIPL1Q9NZN9 384 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 MOSPD1Q9UJG1 213 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 SUFUQ9UMX1 484 aa30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 NAV2Q8IVL1 2488 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 TERTO14746 1132 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 ECEL1O95672 775 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 FTLP02792 175 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 IVLP07476 585 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 CCL4P13236 92 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 IL1R2P27930 398 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 ETV3P41162 512 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 PRKCIP41743 596 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 SASS6Q6UVJ0 657 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 POLNQ7Z5Q5 900 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 HTR3CQ8WXA8 447 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa30.14■■■□□ 2.42
ALYREF-202ENST00000505490 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC53A6NM62 1247 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 SOD1P00441 154 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 CPP00450 1065 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 AK4P27144 223 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 CSRP3P50461 194 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF235Q14590 738 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 TBR1Q16650 682 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 HAUS4Q9H6D7 363 aa30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PTPN13Q12923 2485 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 RHPN2P1A8MT19 583 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.413e-27■■■■□ 20.6
ALYREF-202ENST00000505490 PGLSO95336 258 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 SFTPCP11686 197 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 NFKBIAP25963 317 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 LIMK2P53671 638 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 CTBSQ01459 385 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM164Q5U3C3 297 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 Q6ZVL8 140 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 NLRP8Q86W28 1048 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PAF1Q8N7H5 531 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 FUCA2Q9BTY2 467 aa30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 H3BRJ5 948 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PPM1DO15297 605 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 ZW10O43264 779 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 FZD6O60353 706 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 AMPD1P23109 780 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 ALDH4A1P30038 563 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 ADCY8P40145 1251 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 GNPDA1P46926 289 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 AMZ1Q400G9 498 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 BOLA3Q53S33 107 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 OR4D9Q8NGE8 314 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PIH1D2Q8WWB5 315 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PATE1Q8WXA2 126 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 CSPG4P5Q96PW8 444 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 FAM117AQ9C073 453 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 SCINQ9Y6U3 715 aa30.11■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 STMND1H3BQB6 276 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 AGRPO00253 132 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 FAM87AP0C7U9 286 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 TCF4P15884 667 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PEX6Q13608 980 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 TMCO3Q6UWJ1 677 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 TSPAN33Q86UF1 283 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 RCBTB1Q8NDN9 531 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC74BQ96LY2 380 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 TAAR9Q96RI9 348 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 SLC12A9Q9BXP2 914 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 ISCUQ9H1K1 167 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 WDR70Q9NW82 654 aa30.1■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 CYSRT1A8MQ03 144 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 SUV39H1O43463 412 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 POLD2P49005 469 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 PTPRRQ15256 657 aa30.09■■■□□ 2.41
ALYREF-202ENST00000505490 SLC30A9Q6PML9 568 aa30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms