RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 INTS14Q96SY0 518 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PCYT2Q99447 389 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PIP5K1AQ99755 562 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 GPA33Q99795 319 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SLC29A1Q99808 456 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 NT5MQ9NPB1 228 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CBLCQ9ULV8 474 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 GDAQ9Y2T3 454 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 BTBD19C9JJ37 291 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 LGALS8O00214 317 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 NTSR2O95665 410 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINA3P01011 423 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 IGHEP01854 428 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TCF4P15884 667 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PTNP21246 168 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 GPTP24298 496 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PRKCHP24723 683 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 IL1R2P27930 398 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 POU1F1P28069 291 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 EPHB3P54753 998 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 LGALS4P56470 323 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 NOMO3P69849 1222 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PLAURQ03405 335 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 RTP2Q5QGT7 225 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 KRT40Q6A162 431 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TTC23LQ6PF05 361 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 HTR3DQ70Z44 454 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FAM35AQ86V20 835 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FAM228AQ86W67 206 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 NUDT13Q86X67 352 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FBXO11Q86XK2 927 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TIGD4Q8IY51 512 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TMIEQ8NEW7 156 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 RLN3Q8WXF3 142 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 GATA6Q92908 595 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 TP53INP1Q96A56 240 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MED30Q96HR3 178 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PGBD1Q96JS3 809 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FAM84AQ96KN4 292 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FBXL18Q96ME1 805 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 DPH1Q9BZG8 443 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CDT1Q9H211 546 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 EPC1Q9H2F5 836 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 CDH22Q9UJ99 828 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ADCY9O60503 1353 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PDCD4-211ENST00000498367 A0A087WV48 116 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0A6YYJ9 748 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 OR2A25A4D2G3 310 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 BTBD17A6NE02 478 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC53A6NM62 1247 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCD4-211ENST00000498367 DBX1A6NMT0 343 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms