RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497315.5

PSMD6-211, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 6, human

TSL 3

Gene PSMD6, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD6-211	ENST00000497315	CLCN3	P51790	818 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	NFATC4	Q14934	902 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	CTF1	Q16619	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	USP6NL	Q92738	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	C1orf226	A1L170	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SLC28A2	O43868	658 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ZBED4	O75132	1171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	PEX5	P50542	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	RALBP1	Q15311	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ACOX2	Q99424	681 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	IL25	Q9H293	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	AP3D1	O14617	1153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	PTP4A3	O75365	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	TIPRL	O75663	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	KDM4B	O94953	1096 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	CLDN14	O95500	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	EGF	P01133	1207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	RAD23B	P54727	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GALC	P54803	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	TUBA1B	P68363	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	CALCRL	Q16602	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	NDUFS3	O75489	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GAGE7	O76087	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	BDKRB2	P30411	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GAGE1	Q13065	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	GAGE4	Q13068	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	NAB2	Q15742	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	HYI	Q5T013	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMD6-211	ENST00000497315	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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