RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	GJB3	O75712	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	TSPAN9	O75954	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CH25H	O95992	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CSH1	P0DML2	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CSH2	P0DML3	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ARRB2	P32121	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	RAD23B	P54727	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	GALC	P54803	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ZBED6	P86452	979 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	NAB2	Q15742	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ACOX2	Q99424	681 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	C1orf226	A1L170	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	MYMK	A6NI61	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	JRK	O75564	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM11	P17152	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CDC25A	P30304	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	HOXC9	P31274	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ACTN2	P35609	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	KCNJ4	P48050	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CAMP	P49913	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SNX16	P57768	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	TFAP4	Q01664	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	HS6ST1	O60243	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFS7	O75251	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SERPINI2	O75830	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	STX2	P32856	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	ACSL1	P33121	698 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	TAS2R40	P59535	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	DSC1	Q08554	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	EPS8	Q12929	822 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms