RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
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PRAME-213ENST00000492657 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
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PRAME-213ENST00000492657 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-213ENST00000492657 ANKS3Q6ZW76 656 aa12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-213ENST00000492657 NAT14Q8WUY8 206 aa12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF840PA6NDX5 716 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 H7C4K7 107 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 CBX4O00257 560 aa12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-213ENST00000492657 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 NME5P56597 212 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 SH3BP2P78314 561 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PFKFB4Q16877 469 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 MRNIPQ6NTE8 343 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 LAYNQ6UX15 382 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 CCDC126Q96EE4 140 aa12.84□□□□□ -0.35
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