RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 QPCTQ16769 361 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 CHST9Q7L1S5 443 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PARGQ86W56 976 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF276Q8N554 614 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SETD9Q8NE22 299 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 FLCNQ8NFG4 579 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ZFP28Q8NHY6 868 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 B3GALT6Q96L58 329 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 TSSK3Q96PN8 268 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 OSBPL10Q9BXB5 764 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 DNM1LO00429 736 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 GNRH1P01148 92 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 APODP05090 189 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 VAV1P15498 845 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PTPN2P17706 415 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ASPAP45381 313 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 CDH4P55283 916 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 NXNL1Q96CM4 212 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 GPR21Q99679 349 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 TCF25Q9BQ70 676 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PLLPQ9Y342 182 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 NRP1O14786 923 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 FAM20BO75063 409 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ENTPD5O75356 428 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 TBX18O95935 607 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 FGFR3P22607 806 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 COPZ1P61923 177 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 KCNJ2P63252 427 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 DLG2Q15700 870 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PPM1JQ5JR12 505 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 TWNKQ96RR1 684 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SPAG4Q9NPE6 437 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SNED1Q8TER0 1413 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 MYH8P13535 1937 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0U1RQF3 1178 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 NEDD8Q15843 81 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SYPL2Q5VXT5 272 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 CUZD1Q86UP6 607 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 HMCESQ96FZ2 354 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 FBXL18Q96ME1 805 aa13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 MAPKAPK2P49137 400 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RPS24P62847 133 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SLC1A5Q15758 541 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SPESP1Q6UW49 350 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ISLR2Q6UXK2 745 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 C17orf64Q86WR6 236 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 CAMK1DQ8IU85 385 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 HEXDCQ8WVB3 486 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RORBQ92753 470 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RNFT2Q96EX2 444 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 FERD3LQ96RJ6 166 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 KCTD5Q9NXV2 234 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 URADA6NGE7 173 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 IQCF5A8MTL0 148 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SLC28A1O00337 649 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RFXANKO14593 260 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PMM2O15305 246 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 OR10H2O60403 315 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 IPO13O94829 963 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PSMG1O95456 288 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PRAMEF1O95521 474 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SERPINA6P08185 405 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ITPKAP23677 461 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 SOX6P35712 828 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RPL3P39023 403 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 RXRGP48443 463 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 HADHBP55084 474 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 CA9Q16790 459 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF544Q6NX49 715 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 MACC1Q6ZN28 852 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 CPNE8Q86YQ8 564 aa13.34□□□□□ -0.27
HDLBP-241ENST00000487169 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms