RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473322.1

CCDC66-215, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 3

Gene CCDC66, Length 654 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-215	ENST00000473322	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322		A0A0A0MQY5	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322		A6NL46	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	INPPL1	O15357	1258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	KLK8	O60259	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	NKX2-2	O95096	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ITGAX	P20702	1163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	MPG	P29372	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	HOXC9	P31274	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SHMT1	P34896	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	KCNC3	Q14003	757 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	HSPB2	Q16082	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322		Q8NFD4	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CDT1	Q9H211	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	OGG1	O15527	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	PSMD10	O75832	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	RNF8	O76064	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	C22orf31	O95567	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	NFATC1	O95644	943 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	MMP2	P08253	660 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	HOXC13	P31276	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SLC16A2	P36021	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	MMP14	P50281	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	RAB28	P51157	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	GRIK3	Q13003	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	MTA1	Q13330	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	IL11RA	Q14626	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	EGFL8	Q99944	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-215	ENST00000473322	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms