RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IL12RB2Q99665 862 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CALN1Q9BXU9 219 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC2A11Q9BYW1 496 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10A5Q9H207 317 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.14□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SUN2Q9UH99 717 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 USP25Q9UHP3 1055 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DERAQ9Y315 318 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KCTD3Q9Y597 815 aa4.14□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 CHD5Q8TDI0 1954 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 HIVEP2P31629 2446 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM227AF5H4B4 570 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 DUX1O43812 170 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TLR5O60602 858 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CUTAO60888 179 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ADRB2P07550 413 aa4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 GOT1P17174 413 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TCN2P20062 427 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SSTR2P30874 369 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC8A1P32418 973 aa4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 ETV5P41161 510 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ART1P52961 327 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC16A1P53985 500 aa4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB133Q30KQ1 61 aa4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 SNX30Q5VWJ9 437 aa4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM215Q68D42 235 aa4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 XYLT1Q86Y38 959 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DENND1CQ8IV53 801 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
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ECHDC1-211ENST00000460558 BICD1Q96G01 975 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SYT15Q9BQS2 421 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 POLD4Q9HCU8 107 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DLL4Q9NR61 685 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DPP3Q9NY33 737 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CYTH4Q9UIA0 394 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KCND3Q9UK17 655 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PADI4Q9UM07 663 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 L1RE1Q9UN81 338 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 C2CD2Q9Y426 696 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.13□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OR14I1A6ND48 311 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CASC3O15234 703 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OGTO15294 1046 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC16A4O15374 487 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 AQP9O43315 295 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 B3GALT2O43825 422 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DTNBO60941 627 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP2C2O75185 946 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDH8O95206 1070 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 APOL3O95236 402 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CBX6O95503 412 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IL18BPO95998 194 aa4.12□□□□□ -1.75
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