RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434982.2

ANKRD55-202, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD55, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-202ENST00000434982 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 SP110Q9HB58 689 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 GPR27Q9NS67 375 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 IFNKQ9P0W0 207 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DKK3Q9UBP4 350 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 A8MX80 341 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 K7ESM1 405 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 SCAMP1O15126 338 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 MUSKO15146 869 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ECEL1O95672 775 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 SERPING1P05155 500 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ALPPL2P10696 532 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 THOP1P52888 689 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PFN3P60673 137 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ZBED6P86452 979 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 IL10RBQ08334 325 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ELP6Q0PNE2 266 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DPYSQ14117 519 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 IRF4Q15306 451 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 UGP2Q16851 508 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CFAP58Q5T655 872 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PAF1Q8N7H5 531 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 NUP85Q9BW27 656 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DONSONQ9NYP3 566 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 A0A087X0T9 212 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TSPAN11A1L157 253 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 NEMP2A6NFY4 417 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 AQP9O43315 295 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 GYPCP04921 128 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PCCBP05166 539 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TPM3P06753 285 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 FAM228BP0C875 321 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CDK4P11802 303 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CKMT1AP12532 417 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 C6P13671 934 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CASP14P31944 242 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PCK1P35558 622 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ARL4AP40617 200 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 HCAR3P49019 387 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 SCNN1BP51168 640 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 BCL2L1Q07817 233 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ILKQ13418 452 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PTK2BQ14289 1009 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 GRM3Q14832 879 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 LRRC14Q15048 493 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TCEA2Q15560 299 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DPYSL2Q16555 572 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 BOLA3Q53S33 107 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 FAXCQ5TGI0 409 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ERAP2Q6P179 960 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.8 ms