RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401596.1

CNN3P1-201, Transcript of calponin 3 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CNN3P1, Length 935 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3P1-201ENST00000401596 A0A087X1B8 175 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 K7ERQ8 282 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 AURKAO14965 403 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 KLHL2O95198 593 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 PRAMEF12O95522 483 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CYBBP04839 570 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 APOA4P06727 396 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 DLDP09622 509 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CISD3P0C7P0 127 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CEBPBP17676 345 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 FDXRP22570 491 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CA8P35219 290 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 HMGCLP35914 325 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 PRKAA2P54646 552 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 TAS2R39P59534 338 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 RAB10P61026 200 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 RHOAP61586 193 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 NTHL1P78549 312 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 XIAPP98170 497 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SULT2A1Q06520 285 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 BST1Q10588 318 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 IFT88Q13099 833 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SEPT6Q14141 434 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 GALNT3Q14435 633 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SEMA3AQ14563 771 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 DLG2Q15700 870 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 FUT11Q495W5 492 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ATG16L1Q676U5 607 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 C16orf46Q6P387 395 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CNSTQ6PJW8 725 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 LINGO4Q6UY18 593 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 TMEM25Q86YD3 366 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CEP97Q8IW35 865 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 VN1R2Q8NFZ6 395 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 OR4L1Q8NH43 312 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 EDAQ92838 391 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 TCF12Q99081 682 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 THAP1Q9NVV9 213 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF358Q9NW07 568 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 IL17CQ9P0M4 197 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 HAO1Q9UJM8 370 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 MID2Q9UJV3 735 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ARL5AQ9Y689 179 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.39□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 A0A0J9YYE9 177 aa7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 A0A1W2PQ67 120 aa7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 TSPAN11A1L157 253 aa7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 WDR91A4D1P6 747 aa7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 AGAP14A8MT82 685 aa7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 PER2O15055 1255 aa7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CNN3P1-201ENST00000401596 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms