RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 TLDC2A0PJX2 215 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 GPR39O43194 453 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 GOT2P00505 430 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 BPIP17213 487 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 GABRG2P18507 467 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 TAS2R38P59533 333 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CYS1Q717R9 158 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 SYT13Q7L8C5 426 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 GANCQ8TET4 914 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 RUFY1Q96T51 708 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 PAFAH2Q99487 392 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 OMDQ99983 421 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ZFATQ9P243 1243 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 NEMP1O14524 444 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 STC1P52823 247 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 KLHL38Q2WGJ6 581 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 DENND6AQ8IWF6 608 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 VPS18Q9P253 973 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CD84Q9UIB8 345 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 FADS3Q9Y5Q0 445 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 DCNP07585 359 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ELFN1P0C7U0 828 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 PSMA3P25788 255 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 NFKBIAP25963 317 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 PEX6Q13608 980 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 KRT71Q3SY84 523 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 TJAP1Q5JTD0 557 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 LIPIQ6XZB0 460 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 GPR26Q8NDV2 337 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 HHIPQ96QV1 700 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CCDC77Q9BR77 488 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 COQ6Q9Y2Z9 468 aa25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 RASGRF2O14827 1237 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 SLC7A4O43246 635 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ZNF30P17039 623 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 LIG3P49916 1009 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ELP6Q0PNE2 266 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 FAM151BQ6UXP7 276 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 LRRC6Q86X45 466 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 MFSD1Q9H3U5 465 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 TBK1Q9UHD2 729 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 MC4RP32245 332 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 HADHAP40939 763 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ETV3P41162 512 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 XIAPP98170 497 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CTBP1Q13363 440 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ZNF470Q6ECI4 717 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ANO7Q6IWH7 933 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 NEPROQ6NW34 567 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 Q6ZVL8 140 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 FAM124AQ86V42 546 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 OTUD6BQ8N6M0 293 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CDKL2Q92772 493 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 FAM96AQ9H5X1 160 aa25.35■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 MMP20O60882 483 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 GM2AP17900 193 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 SLC1A2P43004 574 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 SPINT3P49223 89 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 DGKEP52429 567 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 SEMA3AQ14563 771 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 OR4L1Q8NH43 312 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 SLC44A1Q8WWI5 657 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 RAB7BQ96AH8 199 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CENPHQ9H3R5 247 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 IL26Q9NPH9 171 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 SIT1Q9Y3P8 196 aa25.34■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ATP8B1O43520 1251 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ABCG1P45844 678 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 MPP1Q00013 466 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 DCAKDQ8WVC6 231 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CLDN23Q96B33 292 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 DHRS4Q9BTZ2 278 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 CHRDQ9H2X0 955 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 TECTAO75443 2155 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 TCEA3O75764 348 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 IVLP07476 585 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ACADMP11310 421 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 MSH2P43246 934 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 SUOXP51687 545 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 ACOX1Q15067 660 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-202ENST00000377244 AFTPHQ6ULP2 937 aa25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms