RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5K4A6NMS3 321 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1DO15297 605 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGNO95427 931 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 IVLP07476 585 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ITIH2P19823 946 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 COL8A1P27658 744 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CTBSQ01459 385 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 HHEXQ03014 270 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ARCQ7LC44 396 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NAGSQ8N159 534 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR87Q9BY21 358 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SUFUQ9UMX1 484 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 WIPF3A6NGB9 483 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LRIG2O94898 1065 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA10O95299 355 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LDLRP01130 860 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP6P22004 513 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TEAD1P28347 426 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHB2P29323 1055 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SDC4P31431 198 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CSF2RBP32927 897 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ADRA1BP35368 520 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK9P45984 424 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 CSNK1DP48730 415 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RENBPP51606 427 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 DNASE1L3Q13609 305 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 AFMIDQ63HM1 303 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LIPIQ6XZB0 460 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 GBP6Q6ZN66 633 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 DPPA4Q7L190 304 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP14Q86W24 1093 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCKQ8N0W5 287 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC2Q96KP1 924 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2M4Q96R27 311 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX101Q9BY14 249 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE7BQ9NP56 450 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL3Q9UH77 587 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PGGT1B-201ENST00000296642 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JNG1 304 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD62A6NC57 917 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMD11O00231 422 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 PALMO75781 387 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0754O94854 1291 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN1O95832 211 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CEACAM5P06731 702 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ADCY8P40145 1251 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR1P46091 355 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRB2P47870 512 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL11P51671 97 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 NDST2P52849 883 aa7.83□□□□□ -1.16
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