RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsd3b5Q61694 373 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MelkQ61846 643 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smad2Q62432 467 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hs3st2Q673U1 367 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam167aQ6P1G6 215 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr26Q7TRB7 308 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr667Q7TRP4 326 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trit1Q80UN9 467 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B3gnt5Q8BGY6 376 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Elmo2Q8BHL5 732 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rap2cQ8BU31 183 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr21Q8BX79 349 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Osbpl6Q8BXR9 959 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TbcdQ8BYA0 1196 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem154Q8C4Q9 181 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp446Q8C9M8 523 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cacnb2Q8CC27 655 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ipo13Q8K0C1 963 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MfrpQ8K480 584 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cog4Q8R1U1 785 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r213Q8R278 384 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 VitQ8VHI5 650 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NoboxQ8VIH1 527 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FtcdQ91XD4 541 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SncbQ91ZZ3 133 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Frmd4bQ920B0 1035 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PompQ9CQT5 141 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nudt8Q9CR24 210 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pgm1Q9D0F9 562 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrps33Q9D2R8 106 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IgtpQ9DCE9 423 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr933Q9EQA0 308 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prl5a1Q9JII2 230 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ruvbl2Q9WTM5 463 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2g1Q9WV19 494 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Alpk2Q91ZB0 2144 aa9.26□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinb3cA2RSF9 386 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Apol8A2VDH7 339 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nlgn4lB0F2B4 945 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NuggcD3YWJ0 796 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim55G3X8Y1 545 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r54K7N649 806 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CtssO70370 340 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdlim1O70400 327 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DgkaO88673 730 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01810 119 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gstm1P10649 218 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wnt6P22727 364 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adra2bP30545 450 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Folr1P35846 255 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HmgclP38060 325 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ephb2P54763 986 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gabrb3P63080 473 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adcyap1r1P70205 496 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FerP70451 823 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbp2P70695 339 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AurkaP97477 395 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rab33aP97950 237 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 StimateQ3UF25 288 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 G2e3Q5RJY2 716 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GpamQ61586 827 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ltbp3Q61810 1268 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PigaQ64323 485 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nlrp9cQ66X01 1004 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt73Q6NXH9 539 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Casc4Q6P2L7 435 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr834Q7TRG8 312 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sema3dQ8BH34 777 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cox14Q8BH51 57 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mapkap1Q8BKH7 522 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb33Q8BN78 671 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmc7Q8C428 726 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Proser2Q8C5R2 471 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc186Q8C9S4 917 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap61Q8CEL2 1252 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Appl1Q8K3H0 707 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cgref1Q8R1U2 281 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adgrf1Q8VEC3 908 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lgals12Q91VD1 314 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NcaldQ91X97 193 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Retreg3Q9CQV4 466 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem81Q9D5K1 259 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psmd12Q9D8W5 456 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp5hQ9DCX2 161 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nmnat1Q9EPA7 285 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.4 ms