RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554534.5

PCNX4-208, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-208ENST00000554534 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 APPL1Q9UKG1 709 aa6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 FZD10Q9ULW2 581 aa6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SUFUQ9UMX1 484 aa6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CACNA1DQ01668 2161 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 A0A1W2PQC6 194 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 F8VZ95 297 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 STMND1H3BQB6 276 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PALMO75781 387 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 FURINP09958 794 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ELFN1P0C7U0 828 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 RNF224P0DH78 156 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CCNB1P14635 433 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 UCHL3P15374 230 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF28P17035 718 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CR2P20023 1033 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MMP8P22894 467 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 COL8A1P27658 744 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ADCY8P40145 1251 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CCR10P46092 362 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MAXP61244 160 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 FOXK1P85037 733 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CDR2Q01850 454 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ELP6Q0PNE2 266 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NFATC2Q13469 925 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MTM1Q13496 603 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CNGA3Q16281 694 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 Q6ZVL8 140 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NAGSQ8N159 534 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 FAM81BQ96LP2 452 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TBATAQ96M53 351 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MCEEQ96PE7 176 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SEMA3CQ99985 751 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 STK33Q9BYT3 514 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TRIM7Q9C029 511 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PDFQ9HBH1 243 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SEPT3Q9UH03 358 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ITPR2Q14571 2701 aa6.7□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NOTCH2Q04721 2471 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TSPAN11A1L157 253 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 A1L4Q6 167 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 INPP4BO15327 924 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SNX2O60749 519 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PRAMEF11O60813 436 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 MAP3K6O95382 1288 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 KRT7P08729 469 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 GP1BBP13224 206 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SCNN1AP37088 669 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ACTR1BP42025 376 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PTPN9P43378 593 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ATP1A2P50993 1020 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 LIMK2P53671 638 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 KIAA1024LP59773 190 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 TPI1P60174 286 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ACTR1AP61163 376 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 BCL2L1Q07817 233 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 AFMIDQ63HM1 303 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 DPPA4Q7L190 304 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 PGBD5Q8N414 524 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 NPWQ8N729 165 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCNX4-208ENST00000554534 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms