RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549659.1

NKX2-2-AS1-201, NKX2-2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NKX2-2-AS1, Length 638 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TLE3Q04726 772 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ITKQ08881 620 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 GALNT2Q10471 571 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ARHGEF7Q14155 803 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PDK2Q15119 407 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 SLC18A3Q16572 532 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 USP45Q70EL2 814 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 DTD2Q96FN9 168 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 SLC46A1Q96NT5 459 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 SEMA3CQ99985 751 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ZNF670Q9BS34 389 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ITPR1Q14643 2758 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PRSS38A1L453 326 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 LHCGRP22888 699 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ETV3P41162 512 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 MAML1Q92585 1016 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TEX101Q9BY14 249 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 NBEAQ8NFP9 2946 aa22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 MATN3O15232 486 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CBFA2T2O43439 604 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PDHA1P08559 390 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 KRT7P08729 469 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 KRT10P13645 584 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CTPS1P17812 591 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CCNCP24863 283 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PDX1P52945 283 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TAS2R40P59535 323 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CCL7P80098 99 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TRIM14Q14142 442 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PTPRRQ15256 657 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 Q6ZVL8 140 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TSPAN33Q86UF1 283 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TSGA13Q96PP4 275 aa22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CCDC187A0A096LP49 1063 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 FZD6O60353 706 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 MAP3K6O95382 1288 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 GLB1P16278 677 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CES1P23141 567 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 KCNE4Q8WWG9 221 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 FATE1Q969F0 183 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 FAF2Q96CS3 445 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 DNAJC7Q99615 494 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 LRRN3Q9H3W5 708 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 DPEP2Q9H4A9 486 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 DEF6Q9H4E7 631 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 HAUS2Q9NVX0 235 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 AMACRQ9UHK6 382 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 APPL1Q9UKG1 709 aa21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 A0A1W2PQM1 296 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 GOLGA6BA6NDN3 693 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 NOBOXO60393 691 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CEACAM5P06731 702 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 TEAD1P28347 426 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 CDK3Q00526 305 aa21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms