RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	RPS6KA2	Q15349	733 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	C1orf50	Q9BV19	199 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SMOX	Q9NWM0	555 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	MAP10	Q9P2G4	905 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	GFAP	P14136	432 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	RIN3	Q8TB24	985 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM74	Q96NL1	305 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	INPP4B	O15327	924 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	TFPT	P0C1Z6	253 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	PLCL1	Q15111	1095 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	OR4D1	Q15615	310 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	CARM1	Q86X55	608 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	TSGA13	Q96PP4	275 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	RANBP9	Q96S59	729 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SEPHS2	Q99611	448 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	CD300A	Q9UGN4	299 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SLC22A2	O15244	555 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	PCSK1	P29120	753 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SLC7A1	P30825	629 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	HSPA13	P48723	471 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	GRB14	Q14449	540 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SEMA3A	Q14563	771 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	SCD5	Q86SK9	330 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	NAT16	Q8N8M0	369 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		18.89	■□□□□ 0.62
MIB2-231	ENST00000518681	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	STAMBP	O95630	424 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	HGF	P14210	728 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	ADAM17	P78536	824 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	PSMD5	Q16401	504 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	GAB3	Q8WWW8	586 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	TEX37	Q96LM6	180 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	SP110	Q9HB58	689 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681		A0A0J9YVX5	310 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681		H3BNH8	94 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	PSMD3	O43242	534 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	KPNA6	O60684	536 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	CDK14	O94921	469 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	CTBS	Q01459	385 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	OR2T3	Q8NH03	318 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	EXOC2	Q96KP1	924 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	ANGPT2	O15123	496 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	CACNG3	O60359	315 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	GRK4	P32298	578 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	DNAJB13	P59910	316 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	PTPRR	Q15256	657 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	MAPRE2	Q15555	327 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	KDELC1	Q6UW63	502 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	PLXNB2	O15031	1838 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	ENPP3	O14638	875 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	S1PR4	O95977	384 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	GPX3	P22352	226 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	HK2	P52789	917 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	EFEMP1	Q12805	493 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	DDI1	Q8WTU0	396 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	ACOX2	Q99424	681 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	CMTM6	Q9NX76	183 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	CRCP	O75575	148 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	RBP1	P09455	135 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-231	ENST00000518681	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms