RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CEACAM5	P06731	702 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF28	P17035	718 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	GNPDA1	P46926	289 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MAPKAPK2	P49137	400 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	NDUFA8	P51970	172 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CTBS	Q01459	385 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	OR10G6	Q8NH81	332 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	EXOC2	Q96KP1	924 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	KCND3	Q9UK17	655 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276		A6NCN8	305 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RAMP2	O60895	175 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CREG1	O75629	220 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	GM2A	P17900	193 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SNX16	P57768	344 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RALGDS	Q12967	914 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PEX6	Q13608	980 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	NR6A1	Q15406	480 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	LIPI	Q6XZB0	460 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276		Q8NA96	180 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	BECN2	A8MW95	431 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RECK	O95980	971 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	F13A1	P00488	732 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ELFN1	P0C7U0	828 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RHOQ	P17081	205 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ADCY8	P40145	1251 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	USP8	P40818	1118 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	FASLG	P48023	281 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	NCSTN	Q92542	709 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM53C-208	ENST00000511276	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29

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