RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SNF8	Q96H20	258 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CGREF1	Q99674	301 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	MROH8	Q9H579	483 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672		A0A0G2JPF8	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	UBXN8	O00124	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	APAF1	O14727	1248 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ASAP2	O43150	1006 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	NCK2	O43639	380 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ERLIN2	O94905	339 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SLITRK3	O94933	977 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ANXA6	P08133	673 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	UBL4A	P11441	157 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SCG2	P13521	617 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM11	P17152	192 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ANXA13	P27216	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SOX6	P35712	828 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TM4SF4	P48230	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SULT1E1	P49888	294 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	HYAL1	Q12794	435 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CETN1	Q12798	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RAB30	Q15771	203 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SNCB	Q16143	134 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672		Q6ZTC4	211 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672		A0A1B0GVC2	190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ZW10	O43264	779 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ADCY5	O95622	1261 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CYP3A4	P08684	503 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	IL10	P22301	178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	S100A1	P23297	94 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CHRNA5	P30532	468 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	GRK5	P34947	590 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	HNF1B	P35680	557 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	HADHA	P40939	763 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TAS2R50	P59544	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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