RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	GLOD4	Q9HC38	313 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		14.76	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CFAP69	A5D8W1	941 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403		A6NNZ2	444 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	FPGT	O14772	594 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ELFN1	P0C7U0	828 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RBP3	P10745	1247 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	C6	P13671	934 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ACADVL	P49748	655 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	LIG3	P49916	1009 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	SEMG2	Q02383	582 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	FGL2	Q14314	439 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	PID1	Q7Z2X4	250 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	SLC25A45	Q8N413	288 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TEKT5	Q96M29	485 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CHKB	Q9Y259	395 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		14.75	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403		A8MX80	341 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RAD51B	O15315	384 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	C1S	P09871	688 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CKMT2	P17540	419 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RBL1	P28749	1068 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	VIPR1	P32241	457 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	SKOR1	P84550	965 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	WASHC5	Q12768	1159 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ARHGEF7	Q14155	803 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	LIPI	Q6XZB0	460 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	OR13H1	Q8NG92	308 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	SCRN2	Q96FV2	425 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	14.74	□□□□□ -0.05	3e-7	■■□□□ 13.6
NOP58-208	ENST00000488403	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CARD9	Q9H257	536 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	DKK4	Q9UBT3	224 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		14.74	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TRIM38	O00635	465 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	KCNN4	O15554	427 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	SIGLEC6	O43699	453 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	FZD6	O60353	706 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	MMP2	P08253	660 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	PDHA1	P08559	390 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CTPS1	P17812	591 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	DGKA	P23743	735 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RALGDS	Q12967	914 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	LRRC14	Q15048	493 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ACOX1	Q15067	660 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	HES3	Q5TGS1	186 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403		Q6ZSR6	202 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	IFT43	Q96FT9	208 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	ATRX	P46100	2492 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		14.73	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	POM121B	A6NF01	834 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	KIF5C	O60282	957 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	CDK4	P11802	303 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	NFKB1	P19838	968 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	HNF1B	P35680	557 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	RABIF	P47224	123 aa		14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
NOP58-208	ENST00000488403	IHH	Q14623	411 aa		14.72	□□□□□ -0.05

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