RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH16	O75309	829 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ACSL3	O95573	720 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TTC4	O95801	387 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GSTA2	P09210	222 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNA3	P22001	575 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	HOXD13	P35453	343 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	VHL	P40337	213 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NOV	P48745	357 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FMO5	P49326	533 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CASP5	P51878	434 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GPC5	P78333	572 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	MYL7	Q01449	175 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	KRT17	Q04695	432 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CUL3	Q13618	768 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PTK6	Q13882	451 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GIT2	Q14161	759 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	UBE2S	Q16763	222 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	AADACL2	Q6P093	401 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SESTD1	Q86VW0	696 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TERB1	Q8NA31	727 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	BBOF1	Q8ND07	529 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF398	Q8TD17	642 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	KRT35	Q92764	455 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	KIFAP3	Q92845	792 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ERP27	Q96DN0	273 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF333	Q96JL9	665 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	C5orf34	Q96MH7	638 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	LRRC19	Q9H756	370 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	COG5	Q9UP83	839 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	C2CD2	Q9Y426	696 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ALG6	Q9Y672	507 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	STRC	Q7RTU9	1775 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NRAP	Q86VF7	1730 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983		A0A1W2PRG0	241 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983		E5RJQ4	531 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PDLIM1	O00151	329 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TBX3	O15119	743 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CLIC2	O15247	247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	MED24	O75448	989 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GCNT3	O95395	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GAS8	O95995	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PRKCB	P05771	671 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ABHD2	P08910	425 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PF4V1	P10720	104 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NPR1	P16066	1061 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CREB1	P16220	341 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	KLRK1	P26718	216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	MARK3	P27448	753 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PTPN4	P29074	926 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FOXN2	P32314	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CHKA	P35790	457 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNJ5	P48544	419 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CASP4	P49662	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TUB	P50607	506 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC18A1	P54219	525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TPTE	P56180	551 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	LAMB3	Q13751	1172 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms