RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MC1RQ01726 317 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MALLQ13021 153 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ADRM1Q16186 407 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB109BQ30KR1 87 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 JADE1Q6IE81 842 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NEK8Q86SG6 692 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IRF2BP1Q8IU81 584 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CD302Q8IX05 232 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 BLIDQ8IZY5 108 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF366Q8N895 744 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DTX3Q8N9I9 347 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ABHD4Q8TB40 342 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CALML6Q8TD86 181 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MVB12AQ96EY5 273 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 P2RY11Q96G91 374 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LRGUKQ96M69 825 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF560Q96MR9 790 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PKMYT1Q99640 499 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CMKLR1Q99788 373 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OMDQ99983 421 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 BTBD2Q9BX70 525 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NEUROG2Q9H2A3 272 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MTG2Q9H4K7 406 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS16Q9NQE7 514 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.15□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT19A8MXV4 375 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 C10orf142B7Z368 130 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3LB9A6J9 549 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 F8VP50 259 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 K7EM74 188 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TPP1O14773 563 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NKX2-8O15522 239 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GRID2O43424 1007 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TUSC2O75896 110 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 WNT11O96014 354 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3HP0C7X1 549 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 BDNFP23560 247 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 YWHAQP27348 245 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PNPLA4P41247 253 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NPTX2P47972 431 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LHX1P48742 406 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ADPRHP54922 357 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP2CBP62714 309 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP2CAP67775 309 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CST6Q15828 149 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC142Q17RM4 750 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LIPIQ6XZB0 460 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CBLL1Q75N03 491 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXO32Q969P5 355 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 WBP2Q969T9 261 aa4.14□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.14□□□□□ -1.75
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