RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 VNN2O95498 520 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 GPANK1O95872 356 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CSH1P0DML2 217 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CSH2P0DML3 217 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CKMT2P17540 419 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 GLRA2P23416 452 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 LIFRP42702 1097 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SESN3P58005 492 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 OSTNP61366 133 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ASIC1P78348 528 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 STARD3Q14849 445 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DHCR24Q15392 516 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 MUM1Q2TAK8 710 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 C4orf19Q8IY42 314 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 USP7Q93009 1102 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SGF29Q96ES7 293 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NUP58Q9BVL2 599 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DEC1Q9P2X7 70 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 STK36Q9NRP7 1315 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GTQ1 180 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PQF6 199 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CGB1A6NKQ9 187 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 H3BQV1 296 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ACKR2O00590 384 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PRC1O43663 620 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CTDNEP1O95476 244 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ATF6P18850 670 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ARL2P36404 184 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 GAD2Q05329 585 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FAM187BQ17R55 369 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF529Q6P280 563 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 KCNK18Q7Z418 384 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MICU3Q86XE3 530 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TPH2Q8IWU9 490 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 RFFLQ8WZ73 363 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 HPS3Q969F9 1004 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 LXNQ9BS40 222 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ABCG4Q9H172 646 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 LANCL2Q9NS86 450 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TCHHQ07283 1943 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 M0QZQ0 153 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 YKT6O15498 198 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PPP6R2O75170 966 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 CMA1P23946 247 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 DCTP40126 519 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SMARCB1Q12824 385 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 IQCB1Q15051 598 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 Q4G0T1 1027 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 METTL23Q86XA0 190 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 LNX2Q8N448 690 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ARL14Q8N4G2 192 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DEPTORQ8TB45 409 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.47□□□□□ -1.37
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