RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SH3GLB1Q9Y371 365 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPM1 405 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 FGF1P05230 155 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 LINGO4Q6UY18 593 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 KCNE2Q9Y6J6 123 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 OPLAHO14841 1288 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 GCATO75600 419 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 BMP7P18075 431 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 MPPE1Q53F39 396 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF563Q8TA94 476 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CMTM6Q9NX76 183 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ASGR1P07306 291 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 MANFP55145 182 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 NOGQ13253 232 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 IQGAP1P46940 1657 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM38O00635 465 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 STBD1O95210 358 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 APODP05090 189 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CPA6Q8N4T0 437 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 GPR20Q99678 358 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC185Q8N715 623 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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PTPRM-201ENST00000332175 USP4Q13107 963 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ITGADQ13349 1161 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BBS12Q6ZW61 710 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 AMIGO2Q86SJ2 522 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TEX47Q8TBZ9 253 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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PTPRM-201ENST00000332175 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
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PTPRM-201ENST00000332175 RCVRNP35243 200 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 DLG2Q15700 870 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 VWA7Q9Y334 891 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.38■■□□□ 1.17
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PTPRM-201ENST00000332175 PYDC2Q56P42 97 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ING5Q8WYH8 240 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TREHO43280 583 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 DBTP11182 482 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 GABRB2P47870 512 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CHST9Q7L1S5 443 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 TUSC3Q13454 348 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF248Q8NDW4 579 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PRRG4Q9BZD6 226 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 CDH19Q9H159 772 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 UGT2B4P06133 528 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 HNMTP50135 292 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 MRIQ9BWK5 157 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 IQCF5A8MTL0 148 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V0D1P61421 351 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 KCNA10Q16322 511 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 Q96MT0 163 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 DCCP43146 1447 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-201ENST00000332175 C1RP00736 705 aa22.37■■□□□ 1.17
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