RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 CPT1BQ92523 772 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 BIRC7Q96CA5 298 aa16.04■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PRSS16Q9NQE7 514 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GDF3Q9NR23 364 aa16.04■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.04■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 ESYT3A0FGR9 886 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 AP2A1O95782 977 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TUBBP07437 444 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MAGEA6P43360 314 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ITGA8P53708 1063 aa16.03■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 KCNJ11Q14654 390 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CCDC157Q569K6 752 aa16.03■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.03■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 NOD2Q9HC29 1040 aa16.03■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 H0Y8X5 98 aa16.02■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.02■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 IPMKQ8NFU5 416 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 OR2A12Q8NGT7 310 aa16.02■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SKA1Q96BD8 255 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TADA1Q96BN2 335 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 IFT43Q96FT9 208 aa16.02■□□□□ 0.16
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IFT20-201ENST00000322326 SUN1O94901 812 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-201ENST00000322326 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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IFT20-201ENST00000322326 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
IFT20-201ENST00000322326 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
IFT20-201ENST00000322326 PCSK7Q16549 785 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-201ENST00000322326 KCTD11Q693B1 232 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-201ENST00000322326 WDR93Q6P2C0 686 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-201ENST00000322326 KDELC1Q6UW63 502 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-201ENST00000322326 DHRS13Q6UX07 377 aa16.01■□□□□ 0.15
IFT20-201ENST00000322326 USP30Q70CQ3 517 aa16.01■□□□□ 0.15
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