RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mppe1Q80XL7 396 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igsf8Q8R366 611 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zdhhc7Q91WU6 308 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CygbQ9CX80 190 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syvn1Q9DBY1 612 aa21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akap17bA2A3V1 959 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb10E9Q8X5 861 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm6351K9J7D1 481 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Foxm1O08696 760 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bub1O08901 1058 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PolP11369 1281 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tap1P21958 724 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Treml2Q2LA85 329 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nat9Q3UG98 241 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stmnd1Q6P3A1 279 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rxfp4Q7TQP4 414 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pqlc1Q80XM9 271 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf473Q8BI67 892 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Panx3Q8CEG0 392 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snapc1Q8K0S9 389 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GhdcQ99J23 532 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IkbkeQ9R0T8 717 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coro1cQ9WUM4 474 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc2a5Q9WV38 501 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sept5Q9Z2Q6 369 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prim2P33610 505 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Impdh1P50096 514 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smpdl3aP70158 445 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Casc4Q6P2L7 435 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc116Q80X53 541 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acsm2Q8K0L3 575 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mta1Q8K4B0 715 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr589Q8VGV8 317 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B3galt6Q91Z92 325 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Def8Q99J78 448 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nde1Q9CZA6 344 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dus2Q9D7B1 493 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DcpsQ9DAR7 338 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Isca2Q9DCB8 154 aa21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mroh7A2AVR2 1279 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem245B1AZA5 876 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7073E9QAS1 335 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MttpO08601 894 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncam2O35136 837 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Traf6P70196 530 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtf2Q02395 593 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Micall2Q3TN34 1009 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SbplQ3TUY3 232 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdp2Q504M2 532 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nfe2l2Q60795 597 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MelkQ61846 643 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ShbQ6PD21 503 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tlr12Q6QNU9 906 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr538Q7TRT5 310 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arl5aQ80ZU0 179 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B3gnt5Q8BGY6 376 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sirt3Q8R104 334 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhb19Q91Y01 801 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lypd3Q91YK8 363 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tagln3Q9R1Q8 199 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gria3Q9Z2W9 888 aa21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NuggcD3YWJ0 796 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Man2b1O09159 1013 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2b19O55071 492 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl26P61255 145 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q3UK37 420 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mocs1Q5RKZ7 636 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7247Q6UY52 187 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr142Q7TQN9 365 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sfrp1Q8C4U3 314 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ugt2b1Q8R084 529 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Poc5Q9DBS8 558 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adam17Q9Z0F8 827 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r2A2AMT6 306 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PargO88622 969 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itgb7P26011 806 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc8eQ66JT1 795 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl14Q69ZK5 630 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dclk2Q6PGN3 756 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb34Q7TNV8 81 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp719Q8BIV1 735 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.6 ms