RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Arhgef25Q9CWR0 618 aa11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Creb3l4Q9D2A5 370 aa11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MsraQ9D6Y7 233 aa11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q9DAD0 168 aa11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Chst7Q9EP78 484 aa11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fbxo16Q9QZM9 334 aa11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Extl3Q9WVL6 918 aa11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Myo16Q5DU14 1919 aa11.66□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Adgra2Q91ZV8 1336 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Scml2B1AVB3 969 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm6309L7N481 315 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il13ra2O88786 383 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rad52P43352 420 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CidecP56198 239 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Acvrl1Q61288 502 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nfe2l1Q61985 741 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kctd12Q6WVG3 327 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mgat5bQ765H6 792 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zcchc4Q8BKW4 512 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rap2cQ8BU31 183 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ston2Q8BZ60 895 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 HlcsQ920N2 722 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ddi1Q9DAF3 408 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Psmg1Q9JK23 289 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nectin1Q9JKF6 515 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Apold1E9Q0X2 246 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm21915J3QPM7 133 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dpysl4O35098 572 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Impa1O55023 277 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Glud1P26443 558 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Acsl1P41216 699 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp39Q02525 718 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc16a10Q3U9N9 512 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm45902Q3UDN3 361 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Prss36Q5K2P8 849 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wee2Q66JT0 555 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lamp3Q7TST5 411 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Got1l1Q7TSV6 404 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Samd4bQ80XS6 687 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Wdtc1Q80ZK9 677 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cxcr1Q810W6 351 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Katnb1Q8BG40 658 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Thnsl1Q8BH55 747 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 OsgepQ8BWU5 335 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zmiz2Q8CIE2 920 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem82Q8R115 356 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Angptl7Q8R1Q3 337 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Chchd6Q91VN4 273 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Traf7Q922B6 594 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Itfg1Q99KW9 610 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sytl2Q99N50 950 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q9CQC3 228 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GabarapQ9DCD6 117 aa11.65□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tanc1Q0VGY8 1856 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1160A2AVT0 319 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 HgdO09173 445 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Grik2P39087 908 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Smad1P70340 465 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SgcdP82347 289 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Grin2cQ01098 1239 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tff2Q03404 129 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hexim2Q3TVI4 313 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Krt76Q3UV17 594 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PighQ5M9N4 188 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Traf3Q60803 567 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sox17Q61473 419 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znf366Q6NS86 746 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Eri1Q7TMF2 345 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rfx4Q7TNK1 735 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AW551984Q8BGF0 804 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Oscp1Q8BHW2 379 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AgmoQ8BS35 447 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc45a3Q8K0H7 553 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Batf2Q8R1H8 277 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cul2Q9D4H8 745 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 F6Y6L6 278 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PhyhO35386 338 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 C1qbpO35658 278 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NppaP05125 152 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PcnaP17918 261 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Itgb7P26011 806 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 E330014E10RikQ3UL33 481 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 D5Ertd577eQ499F0 481 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ints6Q6PCM2 883 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nemp1Q6ZQE4 437 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp184Q7TSH9 737 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Galnt7Q80VA0 657 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q810S2 196 aa11.64□□□□□ -0.55
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dusp4Q8BFV3 398 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.2 ms