RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	CEBPB	P17676	345 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CA4	P22748	312 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CCNF	P41002	786 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CLCN2	P51788	898 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NEK3	P51956	506 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	USP4	Q13107	963 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNC3	Q14003	757 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF77	Q15935	545 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DUSP6	Q16828	381 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LGSN	Q5TDP6	509 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MROH9	Q5TGP6	573 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RANBP9	Q96S59	729 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LHX3	Q9UBR4	397 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DPP7	Q9UHL4	492 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		15.48	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	EPO	P01588	193 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CNTF	P26441	200 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GP5	P40197	560 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CDK18	Q07002	472 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LMAN2	Q12907	356 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF135	Q8IUD6	432 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CPNE1	Q99829	537 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	INSIG1	O15503	277 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MT-CO1	P00395	513 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ITGA2B	P08514	1039 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CD70	P32970	193 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SCNN1B	P51168	640 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT72	Q14CN4	511 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KLC3	Q6P597	504 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM25	Q86YD3	366 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ITFG1	Q8TB96	612 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NRG4	Q8WWG1	115 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ING5	Q8WYH8	240 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	APOPT1	Q96IL0	206 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		15.47	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HEATR9	A2RTY3	570 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MROH6	A6NGR9	719 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GSC2	O15499	205 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PRL	P01236	227 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TCF3	P15923	654 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HLA-DPA1	P20036	260 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NRIP1	P48552	1158 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SEPT6	Q14141	434 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CNGA3	Q16281	694 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ABHD8	Q96I13	439 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RBBP8	Q99708	897 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PREB	Q9HCU5	417 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MKS1	Q9NXB0	559 aa		15.46	■□□□□ 0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF197	O14709	1029 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	LDB2	O43679	373 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	DNAJC6	O75061	913 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	VAPB	O95292	243 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ASL	P04424	464 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PRKCG	P05129	697 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	FGF1	P05230	155 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ETV4	P43268	484 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SESN3	P58005	492 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SULT2A1	Q06520	285 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	DNAJC3	Q13217	504 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GALNT3	Q14435	633 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	GRTP1	Q5TC63	336 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		15.45	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		15.45	■□□□□ 0.06

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