RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CTHP32929 405 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC1A6P48664 564 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-204ENST00000587718 GAS6Q14393 721 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-204ENST00000587718 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-204ENST00000587718 TXNDC8Q6A555 127 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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CAPNS1-204ENST00000587718 CES3Q6UWW8 571 aa25.6■■□□□ 1.69
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CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0408Q6ZU52 694 aa25.6■■□□□ 1.69
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD27Q96NW4 1050 aa25.6■■□□□ 1.69
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC17A6Q9P2U8 582 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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CAPNS1-204ENST00000587718 TCAF1Q9Y4C2 921 aa25.6■■□□□ 1.69
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV3-27P01718 113 aa25.59■■□□□ 1.69
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CAPNS1-204ENST00000587718 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 MS4A13Q5J8X5 152 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf46Q6P387 395 aa25.56■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 CD248Q9HCU0 757 aa25.56■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 IPMKQ8NFU5 416 aa25.56■■□□□ 1.68
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CAPNS1-204ENST00000587718 FSD1LQ9BXM9 530 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-204ENST00000587718 HPS4Q9NQG7 708 aa25.56■■□□□ 1.68
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