RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	PIRT	P0C851	137 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PAFAH1B1	P43034	410 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	LMAN1	P49257	510 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	FGL2	Q14314	439 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	TEAD4	Q15561	434 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CNGA3	Q16281	694 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	LIPI	Q6XZB0	460 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF592	Q92610	1267 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	RTP4	Q96DX8	246 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	TRIB3	Q96RU7	358 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	25.01	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0U1RQS6	177 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PHF2	O75151	1096 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	LHCGR	P22888	699 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PARP6	Q2NL67	630 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC66	Q68CR7	880 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	APOL2	Q9BQE5	337 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PAK5	Q9P286	719 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		25	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229		E7EVH7	732 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	LRP3	O75074	770 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CD38	P28907	300 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CHRNA4	P43681	627 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	C21orf59	P57076	290 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CLDN2	P57739	230 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	LMNB2	Q03252	620 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SPARCL1	Q14515	664 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		24.99	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	FPGT	O14772	594 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	WNT9A	O14904	365 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	RAD51B	O15315	384 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	AGT	P01019	485 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF806	P0C7X5	589 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	OLIG2	Q13516	323 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CSRP2	Q16527	193 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	TTC27	Q6P3X3	843 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ATL2	Q8NHH9	583 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SKA1	Q96BD8	255 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		24.98	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GVT2	93 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	C10orf142	B7Z368	130 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229		H0Y8X5	98 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	USP12	O75317	370 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CLDN7	O95471	211 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PCCB	P05166	539 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF30	P17039	623 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	HLA-DPA1	P20036	260 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	FDFT1	P37268	417 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	VPS41	P49754	854 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	TERF1	P54274	439 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC14	Q15048	493 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SLC1A5	Q15758	541 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	CREG2	Q8IUH2	290 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	NUS1	Q96E22	293 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		24.97	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		24.96	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	FGF1	P05230	155 aa		24.96	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	24.96	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	24.96	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ETV3	P41162	512 aa		24.96	■■□□□ 1.59
GPS1-223	ENST00000584229	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	24.96	■■□□□ 1.59

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