RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-211ENST00000559850 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.88□□□□□ -0.03
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RABGGTA-211ENST00000559850 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.88□□□□□ -0.03
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RABGGTA-211ENST00000559850 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 LMX1AQ8TE12 382 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 ALG3Q92685 438 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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RABGGTA-211ENST00000559850 CD84Q9UIB8 345 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
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RABGGTA-211ENST00000559850 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 AMACRQ9UHK6 382 aa14.86□□□□□ -0.03
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RABGGTA-211ENST00000559850 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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RABGGTA-211ENST00000559850 C1SP09871 688 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 PYGMP11217 842 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 NR2C2P49116 596 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 SHC2P98077 582 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTA-211ENST00000559850 WASHC5Q12768 1159 aa14.85□□□□□ -0.03
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