RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556867.1

TDP1-216, Transcript of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TDP1, Length 748 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1-216ENST00000556867 CD86P42081 329 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 YPEL5P62699 121 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 XRCC4Q13426 336 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 FZD2Q14332 565 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 NOMO1Q15155 1222 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 SLC14A2Q15849 920 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 TEX44Q53QW1 395 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 GLRX5Q86SX6 157 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 HES6Q96HZ4 224 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 COQ10AQ96MF6 247 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 AGAP3Q96P47 875 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 CHKBQ9Y259 395 aa22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 A0A0J9YYE9 177 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 A8MX80 341 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PSMD11O00231 422 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PRLP01236 227 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 TRBC1P01850 177 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 WASHC5Q12768 1159 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 BNIP3Q12983 259 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 CCDC181Q5TID7 509 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 AADACL2Q6P093 401 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PARGQ86W56 976 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 TEKT5Q96M29 485 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 CDC6Q99741 560 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 GLOD4Q9HC38 313 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.92■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 ALPIP09923 528 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 CTPS1P17812 591 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 THOP1P52888 689 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 EPHB1P54762 984 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 MTM1Q13496 603 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PTK2BQ14289 1009 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 ACOX1Q15067 660 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 TADA1Q96BN2 335 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 VAT1Q99536 393 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.91■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 CAPN8A6NHC0 703 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 TJP3O95049 919 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 CSF2P04141 144 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PCCBP05166 539 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 HNF1BP35680 557 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 ARHGEF7Q14155 803 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 PTPRRQ15256 657 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 MACC1Q6ZN28 852 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 ACTL9Q8TC94 416 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.9■■□□□ 1.26
TDP1-216ENST00000556867 SDC3O75056 442 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 PIAS2O75928 621 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 INPP5AQ14642 412 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 NUS1Q96E22 293 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 DTD2Q96FN9 168 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 SMIM14Q96QK8 99 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 TRIB3Q96RU7 358 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 LYSMD1Q96S90 227 aa22.89■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 H7C0C1 242 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 ZNF30P17039 623 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 DGKAP23743 735 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 PMLP29590 882 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 ATP5OP48047 213 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 QPCTQ16769 361 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 LRRC66Q68CR7 880 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 ZNF567Q8N184 647 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 APOOQ9BUR5 198 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TDP1-216ENST00000556867 LRP4O75096 1905 aa22.88■■□□□ 1.25
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