RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 SYCE1LA8MT33 242 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 H3BNX3 289 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ACSL4O60488 711 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TLR5O60602 858 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CLDN11O75508 207 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CNTN5O94779 1100 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PYGLP06737 847 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 LYNP07948 512 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 LINGO3P0C6S8 592 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SELPP16109 830 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CD9P21926 228 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PSMA3P25788 255 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PMLP29590 882 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GRK4P32298 578 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ALDH1A3P47895 512 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GPR15P49685 360 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PGFP49763 221 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 APLP1P51693 650 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MAXP61244 160 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ADGRE1Q14246 886 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PTK2BQ14289 1009 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MMEL1Q495T6 779 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SDHAF4Q5VUM1 108 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 FUT10Q6P4F1 479 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MIB1Q86YT6 1006 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 UCMAQ8WVF2 138 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SEPT8Q92599 483 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 IGSF8Q969P0 613 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ROPN1LQ96C74 230 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SGF29Q96ES7 293 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TRIM15Q9C019 465 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PDFQ9HBH1 243 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ASB3Q9Y575 518 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ILVBLA1L0T0 632 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 DYTNA2CJ06 578 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 F8W810 466 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 H0YJX3 145 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 KDELR3O43731 214 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 AP1G1O43747 822 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 AHCYL1O43865 530 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TBC1D4O60343 1298 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 B4GALT3O60512 393 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 KERAO60938 352 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ZMPSTE24O75844 475 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 FGF4P08620 206 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CD1DP15813 335 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CDC25CP30307 473 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CCR10P46092 362 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 STC1P52823 247 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 THOP1P52888 689 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 OXCT1P55809 520 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PSME3P61289 254 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SP3Q02447 781 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GNA12Q03113 381 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 RAD51Q06609 339 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TRIM32Q13049 653 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 COQ5Q5HYK3 327 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 REP15Q6BDI9 236 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms