RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 SCML1Q9UN30 329 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 MT-ND3P03897 115 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 GKP32189 559 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 VIPR1P32241 457 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 IL12RB1P42701 662 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SERPINB9P50453 376 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ZBTB16Q05516 673 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRO-210ENST00000544244 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SNX19Q92543 992 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CAVIN3Q969G5 261 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ALG14Q96F25 216 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SPACA7Q96KW9 195 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 MTG2Q9H4K7 406 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CASS4Q9NQ75 786 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 PLAAQ9Y263 795 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 LOC730098B7Z3J9 87 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ATP8B1O43520 1251 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 AVILO75366 819 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM63AO94886 807 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 VAPBO95292 243 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CHRNA4P43681 627 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ZP2Q05996 745 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TRAF2Q12933 501 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CASP8Q14790 479 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CST6Q15828 149 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ARMC3Q5W041 872 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SKA1Q96BD8 255 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SPATA16Q9BXB7 569 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 NEU3Q9UQ49 428 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF711Q9Y462 761 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SUN1O94901 812 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF30P17039 623 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SPRP35270 261 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CRADDP78560 199 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 BIRC2Q13490 618 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 NAB1Q13506 487 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TRADDQ15628 312 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ANO7Q6IWH7 933 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 NEPROQ6NW34 567 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 KDELC1Q6UW63 502 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CES3Q6UWW8 571 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 RAPH1Q70E73 1250 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC63Q8NA47 563 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 FBF1Q8TES7 1133 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SOX13Q9UN79 622 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 PTPRSQ13332 1948 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 WASH3PC4AMC7 463 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 E5RI56 91 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 LAMTOR5O43504 91 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 OXTRP30559 389 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 SLCO1A2P46721 670 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 RGRP47804 291 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRO-210ENST00000544244 CXCL12P48061 93 aa5.68□□□□□ -1.5
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