RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 FPGTO14772 594 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 C21orf59P57076 290 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 SNX1Q13596 522 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 QPCTQ16769 361 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 COG1Q8WTW3 980 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 PARD6AQ9NPB6 346 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 DOCK9Q9BZ29 2069 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBB4AP04350 444 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKCGP05129 697 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMB4P28070 264 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 HNF1BP35680 557 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC6Q16204 474 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 CCHCR1Q8TD31 782 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 KLK6Q92876 244 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 MS4A14Q96JA4 679 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEE1Q9HCI5 957 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 UBP1Q9NZI7 540 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 PAK5Q9P286 719 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-212ENST00000508338 FRYLO94915 3013 aa26.89■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 A6NNZ2 444 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGAP33O14559 1287 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 DFNA5O60443 496 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 IFNB1P01574 187 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 FGF1P05230 155 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CTPS1P17812 591 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 FDFT1P37268 417 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GDF10P55107 478 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 IRX4P78413 519 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGAP8P85298 464 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 FGL2Q14314 439 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC14Q15048 493 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CNGA3Q16281 694 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CYP1B1Q16678 543 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GSTA5Q7RTV2 222 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PRELID2Q8N945 189 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 IPMKQ8NFU5 416 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ATL2Q8NHH9 583 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CENPTQ96BT3 561 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHDC7BQ96G42 594 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 MRGPRX2Q96LB1 330 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 TRABDQ9H4I3 376 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 HACD3Q9P035 362 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRK1Q38SD2 2015 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PR77 199 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PATE3B3GLJ2 98 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ALPIP09923 528 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CASQ1P31415 396 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RABIFP47224 123 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GALNT3Q14435 633 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ACOX1Q15067 660 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CRTC1Q6UUV9 634 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 LNP1A1A4G5 178 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RGSL1A5PLK6 1076 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 TLR4O00206 839 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 WNT9AO14904 365 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CER1O95813 267 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 LHCGRP22888 699 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PAFAH1B1P43034 410 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 YPEL5P62699 121 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC1A5Q15758 541 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC66Q68CR7 880 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 KDELC2Q7Z4H8 507 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 OXR1Q8N573 874 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GRK7Q8WTQ7 553 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 COQ10AQ96MF6 247 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SMOC1Q9H4F8 434 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC40Q9H9A6 602 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RAD18Q9NS91 495 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF292O60281 2723 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PYGLP06737 847 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ENGP17813 658 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 FNTAP49354 379 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GRIK2Q13002 908 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 NRSN1Q8IZ57 195 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CDH19Q9H159 772 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GDF3Q9NR23 364 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH15Q96QU1 1955 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1B0GVT2 93 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms