RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492766.5

RERE-215, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, human

TSL 3

Gene RERE, Length 367 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RERE-215	ENST00000492766	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RERE-215	ENST00000492766	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	POM121B	A6NF01	834 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766		A6NNZ2	444 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FANCG	O15287	622 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SYP	P08247	313 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	NFKBIA	P25963	317 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	HNF1B	P35680	557 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	WNT3A	P56704	352 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	C21orf59	P57076	290 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	NXPH1	P58417	271 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CDK18	Q07002	472 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	AGER	Q15109	404 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LYSMD1	Q96S90	227 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	NDST3	O95803	873 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	C1S	P09871	688 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LIMK1	P53667	647 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	GNG11	P61952	73 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	OVGP1	Q12889	678 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MPP3	Q13368	585 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SNX1	Q13596	522 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	STAT4	Q14765	748 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	IPMK	Q8NFU5	416 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	IFT43	Q96FT9	208 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PBK	Q96KB5	322 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	BMF	Q96LC9	184 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	IL21R	Q9HBE5	538 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TLR4	O00206	839 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PSMD11	O00231	422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FPGT	O14772	594 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	GCAT	O75600	419 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CER1	O95813	267 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PCCB	P05166	539 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PIRT	P0C851	137 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	THEGL	P0DJG4	465 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ZNF30	P17039	623 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ETV3	P41162	512 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CHRNA4	P43681	627 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	STC1	P52823	247 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	GEM	P55040	296 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LRRC14	Q15048	493 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ACOX1	Q15067	660 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CCNG2	Q16589	344 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CDKN3	Q16667	212 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	HLA-B	Q31612	363 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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