RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492167.1

IGKV3-20-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGKV3-20, Length 400 nt, Biotype IG V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-20-201ENST00000492167 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 PROS1P07225 676 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 MMP2P08253 660 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CCNB1P14635 433 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 JUNDP17535 347 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CTPS1P17812 591 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 MX2P20592 715 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 VIPR1P32241 457 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 SLC1A1P43005 524 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 YPEL5P62699 121 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ADCY2Q08462 1091 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 MTM1Q13496 603 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 INPP5AQ14642 412 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 NFATC4Q14934 902 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 LLGL1Q15334 1064 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 TCEA2Q15560 299 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ST3GAL2Q16842 350 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ALG11Q2TAA5 492 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 RFX6Q8HWS3 928 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CNTD1Q8N815 330 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 KRT35Q92764 455 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 IL12RB2Q99665 862 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 FGF22Q9HCT0 170 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 NLGN3Q9NZ94 848 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ALG6Q9Y672 507 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 KNTC1P50748 2209 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CHD6Q8TD26 2715 aa11.69□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 A0A0U1RQJ8 604 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CFAP69A5D8W1 941 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CAPN8A6NHC0 703 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 H3BM21 787 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 SCAMP1O15126 338 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 AQP9O43315 295 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 PRLP01236 227 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 KRT10P13645 584 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CKMT2P17540 419 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ACP1P24666 158 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ETV3P41162 512 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ITKQ08881 620 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 RFLNAQ6ZTI6 216 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CCNYQ8ND76 341 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 LMX1AQ8TE12 382 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 NUS1Q96E22 293 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 DTD2Q96FN9 168 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 APOLD1Q96LR9 279 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 APOOQ9BUR5 198 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CLPBQ9H078 707 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CHKBQ9Y259 395 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.68□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 A0A1W2PQ67 120 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 TMEM202A6NGA9 273 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 TOR1BO14657 336 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 SOD1P00441 154 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 JCHAINP01591 159 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CAPNS1P04632 268 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 C1SP09871 688 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 TSHRP16473 764 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CDC25BP30305 580 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 KIAA1024LP59773 190 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 SKOR1P84550 965 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 AP1B1Q10567 949 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 C1orf61Q13536 156 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 CAMK2BQ13554 666 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 PTK2BQ14289 1009 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 ACOX1Q15067 660 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 SPA17Q15506 151 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 HES3Q5TGS1 186 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 LRRC66Q68CR7 880 aa11.67□□□□□ -0.54
IGKV3-20-201ENST00000492167 DENND2CQ68D51 928 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms