RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 FERD3LQ96RJ6 166 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 EPB41L4BQ9H329 900 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SPAG4Q9NPE6 437 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ANGPT4Q9Y264 503 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LRIG2O94898 1065 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 NUDT14O95848 222 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PPIBP23284 216 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ANXA8L1Q5VT79 327 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TAC4Q86UU9 113 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 IQCKQ8N0W5 287 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBCDQ9BTW9 1192 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DPEP3Q9H4B8 488 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GW55 424 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ENO4A6NNW6 628 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ISM1B1AKI9 464 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 FFAR3O14843 346 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 GPR42O15529 346 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DUX4L2P0CJ85 424 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DUX4L3P0CJ86 424 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DUX4L4P0CJ87 422 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DUX4L5P0CJ88 424 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DUX4L6P0CJ89 424 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DUX4L7P0CJ90 424 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 GPR180Q86V85 440 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 EFCAB3Q8N7B9 438 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TFAP2BQ92481 460 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DUX4Q9UBX2 424 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RAB23Q9ULC3 237 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 MYBPHLA2RUH7 354 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PEX1O43933 1283 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PSMG1O95456 288 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ADSSP30520 456 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CRHR1P34998 444 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SCNN1AP37088 669 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RPL38P63173 70 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 IL10RBQ08334 325 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 BNIP2Q12982 314 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CAMK1DQ8IU85 385 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 OR4K2Q8NGD2 314 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LRRN4Q8WUT4 740 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SDCBP2Q9H190 292 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 KLHL3Q9UH77 587 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 FBXW11Q9UKB1 542 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PTPRJQ12913 1337 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 VAV1P15498 845 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ITGA2P17301 1181 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DRD4P21917 467 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SMIM11AP58511 58 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ECHDC2Q86YB7 292 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PWWP2AQ96N64 755 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 MYRFQ9Y2G1 1151 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ATG13O75143 517 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 POP4O95707 220 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 COL6A1P12109 1028 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RASAL3Q86YV0 1011 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RHBGQ9H310 441 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ERVK-5Q9HDB9 667 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LRRC37A3O60309 1634 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SLC38A8A6NNN8 435 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ASPAP45381 313 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PSME3P61289 254 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ERLEC1Q96DZ1 483 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SPACA7Q96KW9 195 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 OSBPL10Q9BXB5 764 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 VPS4AQ9UN37 437 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 NALCNQ8IZF0 1738 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TGDSO95455 350 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TSNQ15631 228 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 KIAA2013Q8IYS2 634 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ERVW-1Q9UQF0 538 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ARVCFO00192 962 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 FYNP06241 537 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms