RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IQCA1LA6NCM1 817 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ATP6AP2O75787 350 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 S100BP04271 92 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MLNP12872 115 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NCAM1P13591 858 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V1B2P21281 511 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 UBXN11Q5T124 520 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RNF139Q8WU17 664 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 VPS39Q96JC1 886 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DOK1Q99704 481 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 GBA3Q9H227 469 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SUN2Q9UH99 717 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TRPC5OSA6NMA1 111 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DLGAP1O14490 977 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IDUAP35475 653 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ARL4AP40617 200 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NR2C2P49116 596 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SNX17Q15036 470 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MAPRE2Q15555 327 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 INAQ16352 499 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZYG11AQ6WRX3 759 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 EPHX4Q8IUS5 362 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SEPT8Q92599 483 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TOP1MTQ969P6 601 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 C9orf16Q9BUW7 83 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PRDM12Q9H4Q4 367 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZNF385DQ9H6B1 395 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CYP4F12Q9HCS2 524 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TMEM30AQ9NV96 361 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 BFARQ9NZS9 450 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PSME2Q9UL46 239 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NUP205Q92621 2012 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CLDN25C9JDP6 229 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 M0QYT0 321 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CABYRO75952 493 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TPH1P17752 444 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 LILRA4P59901 499 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CBLBQ13191 982 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 LRP8Q14114 963 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZNF460Q14592 562 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PHKG1Q16816 387 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A52Q3SY17 297 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SLC36A3Q495N2 470 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DDIASQ8IXT1 998 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZNF567Q8N184 647 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DGCR6LQ9BY27 220 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NACA2Q9H009 215 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 LRRC40Q9H9A6 602 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 XPR1Q9UBH6 696 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SNX10Q9Y5X0 201 aa13.52□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SDHDO14521 159 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TRIM24O15164 1050 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ELK4P28324 431 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MAP3K7CLP57077 242 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 BEX3Q00994 111 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 INPP5AQ14642 412 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 GRM3Q14832 879 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 WSCD1Q658N2 575 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 LSMEM2Q8N112 164 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ALPK1Q96QP1 1244 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NANOGQ9H9S0 305 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TRIM64CA6NLI5 447 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NRP2O60462 931 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SNAP29O95721 258 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TAF6P49848 677 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TNK2Q07912 1038 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 OXA1LQ15070 435 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 RNF135Q8IUD6 432 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MFSD2AQ8NA29 543 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ABHD11Q8NFV4 315 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms