RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 LZTR1Q8N653 840 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TEKT4Q8WW24 435 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 KLK6Q92876 244 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB7BQ96AH8 199 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 VOPP1Q96AW1 172 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FEM1CQ96JP0 617 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 APOLD1Q96LR9 279 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DNAJC7Q99615 494 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MYOCQ99972 504 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NUP85Q9BW27 656 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZWILCHQ9H900 591 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PDFQ9HBH1 243 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 LHX3Q9UBR4 397 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NENFQ9UMX5 172 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.49□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 WIPF3A6NGB9 483 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 A6NNZ2 444 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 J3KR12 359 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MYO1FO00160 1098 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DFFAO00273 331 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NEMP1O14524 444 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 AREL1O15033 823 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MAP3K7O43318 606 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TSPAN6O43657 245 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TPM1P09493 284 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 THEGLP0DJG4 465 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RARAP10276 462 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CKMT1AP12532 417 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TCF4P15884 667 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CD97P48960 835 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DAB2P98082 770 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 IL10RBQ08334 325 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FGL2Q14314 439 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GRM3Q14832 879 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CYTH1Q15438 398 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC18A3Q16572 532 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 VSTM4Q8IW00 320 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NPWQ8N729 165 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NETO2Q8NC67 525 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF214Q8ND24 703 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 OR13H1Q8NG92 308 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ASB12Q8WXK4 309 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HSPH1Q92598 858 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 BTBD6Q96KE9 485 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 EXOC2Q96KP1 924 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DEF6Q9H4E7 631 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SP110Q9HB58 689 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FZD3Q9NPG1 666 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DKK3Q9UBP4 350 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GGT7Q9UJ14 662 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ITM2BQ9Y287 266 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.48□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1B0GTL3 188 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TSPAN11A1L157 253 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 IGLON5A6NGN9 336 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RAD51BO15315 384 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 INSIG1O15503 277 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SPINT1O43278 529 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MFAP3LO75121 409 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PALMO75781 387 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NEBLO76041 1014 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PIGNO95427 931 aa6.47□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms