RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIOO75962 3097 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ANXA9O76027 345 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ECEL1O95672 775 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 AGTP01019 485 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PRLP01236 227 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SP9P0CG40 484 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGB7P26010 798 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTN2P35609 894 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 P2RY2P41231 377 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GSK3AP49840 483 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TPMTP51580 245 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GEMP55040 296 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT3AP56704 352 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DR1Q01658 176 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMG2Q02383 582 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB16Q05516 673 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 OLIG2Q13516 323 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SPARCL1Q14515 664 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPSAP1Q14558 356 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GRM3Q14832 879 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PTPRRQ15256 657 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ANGPT1Q15389 498 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R7Q15435 360 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CFAP58Q5T655 872 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 KDELC1Q6UW63 502 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC7BQ86TV6 843 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IPMKQ8NFU5 416 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PIH1D2Q8WWB5 315 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TADA1Q96BN2 335 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 SMIM14Q96QK8 99 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 APOL2Q9BQE5 337 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FICDQ9BVA6 458 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 CARD6Q9BX69 1037 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PAK5Q9P286 719 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0U1RQS6 177 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TSPAN11A1L157 253 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 A8MX80 341 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TTI1O43156 1089 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FZD6O60353 706 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SOCS5O75159 536 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PGLSO95336 258 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GAS8O95995 478 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CPP00450 1065 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ADRB3P13945 408 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CTPS1P17812 591 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CA4P22748 312 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXA6P31267 233 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FDFT1P37268 417 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LMAN1P49257 510 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NEK3P51956 506 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EPHB1P54762 984 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TAS2R38P59533 333 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BASP1P80723 227 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CDK18Q07002 472 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GPS1Q13098 491 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MPP3Q13368 585 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PTK6Q13882 451 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GALNT3Q14435 633 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 AGBL4Q5VU57 503 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 USP30Q70CQ3 517 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LONP2Q86WA8 852 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 JAMLQ86YT9 394 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DEFB119Q8N690 84 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MNS1Q8NEH6 495 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SLCO2A1Q92959 643 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 IFT43Q96FT9 208 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms