RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CA4P22748 312 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 HTR1BP28222 390 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 ACADVLP49748 655 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 EPHB1P54762 984 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 PPARDQ03181 441 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 NIPAL4Q0D2K0 466 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF7Q14155 803 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 IHHQ14623 411 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 NFATC4Q14934 902 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 TAZQ16635 292 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 FAXCQ5TGI0 409 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 KAZNQ674X7 775 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 RBFAQ8N0V3 343 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 LMX1AQ8TE12 382 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 COQ10AQ96MF6 247 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 OLFM3Q96PB7 478 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 SLC13A1Q9BZW2 595 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 SPASTQ9UBP0 616 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 FRYQ5TBA9 3013 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 FZD6O60353 706 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 CST8O60676 142 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 MARCKSL1P49006 195 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 DAB2P98082 770 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB17Q13105 803 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRRQ15256 657 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 GATA6Q92908 595 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP23Q9BVJ7 150 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 BRD8Q9H0E9 1235 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 CHKBQ9Y259 395 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 PPIL1Q9Y3C6 166 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 SPEGQ15772 3267 aa24.02■■□□□ 1.44
SMKR1-201ENST00000462322 K7ESM1 405 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 ALPIP09923 528 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 CDK4P11802 303 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 LHCGRP22888 699 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 NR2C2P49116 596 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 VAV2P52735 878 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1328Q86T90 577 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN33Q86UF1 283 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 CNTD1Q8N815 330 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 ATL2Q8NHH9 583 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 KRT35Q92764 455 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 NUS1Q96E22 293 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 CEP41Q9BYV8 373 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 IGF2RP11717 2491 aa24.01■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 BTNL10A8MVZ5 291 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 HNF1BP35680 557 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 ETV3P41162 512 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 CD86P42081 329 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 BLKP51451 505 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf61Q13536 156 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 RD3Q7Z3Z2 195 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM139Q8IV31 216 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 HID1Q8IV36 788 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 EXD1Q8NHP7 514 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 WDR92Q96MX6 357 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 SMIM14Q96QK8 99 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 PCDH9Q9HC56 1237 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 KCTD5Q9NXV2 234 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRBP23467 1997 aa24■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.99■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 A0A0J9YYE9 177 aa23.99■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.99■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 PSMD11O00231 422 aa23.99■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 TRBC1P01850 177 aa23.99■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 PROS1P07225 676 aa23.99■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 TGM2P21980 687 aa23.99■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 ACP1P24666 158 aa23.99■■□□□ 1.43
SMKR1-201ENST00000462322 HK3P52790 923 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms